棕櫚酰化修飾位點鑒定
服務介紹
棕櫚酰化修飾(S-palmitoylation)是指長鏈脂肪酸(通常是指16個碳的棕櫚酸)通過硫酯鍵共價修飾到蛋白質半胱氨酸殘基上,這是一種廣泛存在于生物體內動態、可逆的翻譯后修飾形式,在調控蛋白質的轉運、細胞定位和穩定性等方面都具有非常重要的作用,并與許多疾病的發生、發展關系密切。因此,對棕櫚酰化修飾蛋白質組(包括修飾位點)的鑒定分析具有很重要的意義。
由于棕櫚酰化修飾疏水性強,缺少商品化棕櫚酰化修飾的抗體;且通常發生在中低豐度的蛋白質上,在質譜分析過程中,會受到非棕櫚酰化修飾蛋白質/肽段的影響,進而產生嚴重的信號抑制。因此,需要先對棕櫚化修飾的蛋白進行富集處理,然后通過LC-MS/MS蛋白質定量方法,實現對棕櫚化修飾蛋白的鑒定分析。
蛋白質棕櫚酰化化學結構示意圖
技術路線
生物棕櫚酰化修飾組學檢測采用經典的ABE法,即首先用N-乙基馬來酰亞胺阻斷游離巰基;接著羥胺處理以釋放硫酯連接的棕櫚酰部分,將修飾的半胱氨 酸恢復為巰基;然后使用生物素-HPDP標記羥胺新暴露的硫醇;接著使用鏈霉親和素-瓊脂糖親和純化生物素化的蛋白質,酶解蛋白形成短肽并通過高分辨質譜儀器鑒定棕櫚酰化的蛋白質和修飾位點。
棕櫚酰化修飾位點鑒定技術原理圖
技術優勢
l 操作容易簡單:不需同位素標記,實驗流程簡單
l 高精度與準確性:可鑒定分析具體修飾位點,采用超高分辨質譜儀,獲取更多肽段信息,找到更多修飾位點
l 檢測范圍廣:可檢測各種細胞或者組織中的棕櫚酰化修飾位點
應用方向
l 全面揭示生理病理條件下的蛋白棕櫚酰化特征
l 生理病理分子機制挖掘
l 棕櫚酰化和磷酸化/泛素化等修飾的crosstalk
樣品要求
l 植物組織樣品>500mg,動物組織樣品>20mg;
l 血液樣品至少2ml;
l 尿液樣品>10ml;
l 細胞樣品>5x10
8個細胞;
l 微生物樣品干重500mg。
注意事項
l 請使用足量的干冰運輸,并盡量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。
項目報告
l 實驗步驟
l 質譜參數
l 質譜譜圖
l 鑒定的棕櫚化位點詳細信息
棕櫚化修飾位點鑒定一站式服務
l 您只需下單-寄送樣品
l 明德正康為您完成-樣品處理-上機分析-數據分析-項目報告