宿主殘留蛋白質（HCP）分析
由于純化工藝的限制，治療性藥物中可能會殘留部分HCP蛋白（Host cell proteins），該類蛋白來源于宿主細胞或者細胞培養液，此類蛋白的存在可能會導致藥物產品的療效不穩定，患者的免疫反應等。因而對藥物中HCP蛋白的定性與定量檢測就顯得尤為重要。依賴于抗體識別的ELISA技術可以對HCP蛋白進行定性與定量分析，并且是目前應用最廣泛的技術。但是應用ELISA技術對HCP蛋白進行準確的定性與定量分析的前提是有這些HCP蛋白的標準品以及對應的抗體。HCP蛋白的種類超過數千種，由于標準品以及對應的抗體缺失，無法有效的應用ELISA技術對所有蛋白進行定性與定量分析。同時一個新的生產株中的HCP組成是完全不一樣的，因而可能會使得ELISA技術對蛋白質進行定性、定量分析結果產生誤差。
目前使用LC-MS技術進行HCP蛋白的定性與定量分析已經逐漸被引入到該領域中。質譜是基于蛋白質特異性的氨基酸序列進行蛋白質定性與定量分析的，因而可以避免EILSA方法中由于抗體缺失導致的定性與定量不準確。質譜的檢測動態范圍在6個數量級，可以滿足對絕大部分的HCP蛋白的檢測，結合前端的液相分離手段，可以對復雜的多肽進行分離，進一步提高質譜的檢測靈敏度以及動態范圍。經高分辨質譜測定得到一級及二級質譜譜圖，并進行序列庫搜索匹配后，可得到HCP蛋白的種類列表。同時，使用emPAI（exponentially modified protein abundance index）算法，在對HCP蛋白定性的同時可完成對樣品內HCP蛋白的相對豐度的定量。
圖1 HCP分析流程圖
